Տարբեր մշակույթների, այդ թվում նաև ՀՀ-ի համընդհանուր տեսակետն այն է, որ գենդերը բխում է մարդու սեռից: Այլ կերպ ասած, օրինակ, եթե նորածինը ծնվում է իգական սեռական օրգաններով` ունի հեշտոց, արգանդ, ապա նա պատկանում է իգական սեռի: Նրան անվանում են աղջիկ և ենթադրում, որ երբ աղջիկը մեծանա, լինելու է կին, ով կունենա “կանացի” կեցվածք, հագնվելու և խոսելու ոճ, կսիրի և կամուսնանա տղամարդու ու երեխաներ կունենա: Նմանապես նաև արական սեռի դեպքում է: Մարդկանց մեծամասնության մոտ պահպանվում է հետևյալ օրինաչափությունը` իգական սեռի անհատը պետք է դաստիարակվի “կանացի” սպասելիքներին համապատասխան և իրեն զգա կին, իսկ արական սեռի անհատը` “տղամարդկային” սպասելիքներին համապատասխան և իրեն զգա տղամարդ: Սակայն, կան բազմաթիվ մարդիկ, ովքեր մարտահրավեր են նետում այն պատկերացմանը, որ մեր բոլոր ֆիզիկական, հուզական ու հոգեբանական հատկանիշները պայմանավորված են ի ծնե մեզ տրված սեռական օրգաններով: Լինում են դեպքեր, երբ երեխան ծնվում է, օրինակ, իգական սեռական օրգաններով, նրան անվանում են աղջիկ և դաստիարակում հասարակությունում առկա “կանացիության” սպասելիքներին, վարքագծերին ու դերերին համապատասխան, սակայն աղջիկը իրեն ավելի ներդաշնակ է զգում հասարակությունում առկա “տղամարդկային” սպասելիքների, վարքածգերի ու դերերի հետ և իր ինքնընկալման մեջ (գենդերային ինքնություն) իրեն համարում է տղամարդ:
Գենդերային ինքնությունն անհատի կողմից իր իսկ գենդերի ընկալումն է և անհատական փորձը, որը կարող է համապատասխանել կամ չհամապատասխանել ծննդյան ժամանակ հաստատված սեռին: Այն սոցիալական ինքնության կատեգորիա է և վերաբերում է անհատի նույնականացմանը` որպես տղամարդ, կին կամ այլ գենդեր:
Յուրաքանչյուրս ունի իր գենդերային ինքնությունը, անկախ այն բանից՝ ուզում ենք այն ունենալ, թե ոչ: Գենդերային ինքնությանն անդրադառնալիս կարևոր է տարանջատել տրանսգենդեր հասկացությունը, որը կարող է ներառել տրանսսեքսուալ և տրանսվեստիտ հասկացությունները:
Ցիսգենդերն այն անհատն է, ով նույնականացնում է իրեն ծննդյան ժամանակ հաստատված նույն գենդերի հետ, օրինակ կինն իրեն նույնականացնում է որպես կին, կամ տղամարդը՝ որպես տղամարդ:
Տրանսգենդերությունը գենդերային ինքնության և կենսաբանական սեռի անհամապատասխանելիությունն է: Որոշ տրանսգենդերներ իրենց համարում են հակառակ սեռի ներկայացուցիչ:
Այլ կերպ ասած` մարդիկ են, ովքեր անհարմար են զգում ծննդյան ժամանակ իրենց վերագրված գենդերից, ապրում ու դրսևորում են իրենց այլ գենդերին բնորոշ ձևով և ամենակարևորը`զգում են որպես այլ գենդերի պատկանող անհատ: Օրինակ, նրանք, ովքեր մեծացել են որպես իգական սեռի անհատներ, սկսում են իրենց դրսևորել այնպես, ինչպես դա սովորաբար անում են տղամարդիկ. կարող են հագուստ գնել խանութի տղամարդկանց բաժնից, կարող են շատ կարճ կտրել գլխի մազերը և այլն, ինչպես նաև իրենց համարում են տղամարդ:
Տրանսսեքսուալն այն անհատն է, ով լիովին նույնականանում է հաստատված սեռին հակառակ գենդերային դերին և մշտապես ցանկանում է ապրել նախընտրած գենդերային դերով: Այն հաճախ ուղեկցվում է սեփական առաջնային և երկրորդային սեռային հատկանիշների ուժեղ մերժմամբ և նախընտրած գենդերին բնորոշ մարմին ունենալու ցանկությամբ: Տրանսսեքսուալ անհատը կարող է ցանկանալ բժշկական միջամտություն իրականացնել, սակայն վերջինս պարտադիր պայման չի հանդիսանում, ինչպես նաև կարող է իրականացնել սոցիալական փոփոխություն արականից իգական կամ իգականից արական, որը բազմաթիվ , բայց ոչ բոլոր դեպքերում, ներառում է նաև սոմատիկ փոփոխություն հակառակ սեռի հորմոնային թերապիայի և սեռական օրգանների վիրահատությամբ/սեռի փոփոխության վիրահատություն/:
Այլ կերպ ասած`տրանսսեքսուալ անձանց ոչ միայն գենդերային ինքնությունն է, որ չի համապատասխանում ծննդյան ժամանակ նրանց վերագրվող գենդերին, այլև նրանք ունեն նշանակալի անհարմություն սեփական կենսաբանական սեռի հետ: Օրինակ, եթե անհատի կենսաբանական սեռն արական է, սակայն նա զգում է, որ “սխալ” մարմնում է ծնվել և ցանկանում է լինել իգական սեռի, ապա նա ունի անհարմարություն սեփական կենսաբանական սեռի նկատմամբ: Նման զգացողություն ունեցող անհատները կամ պետք է համակերպվեն սեփական մարմնի հետ, կամ փոփոխեն սեռը` հորմոնային թերապիայի և վիրահատության միջոցով:
Այն անհատներին, ում արդեն իրականացրել են սեռի փոփոխություն, անվանում ենք ԻՍՏ (իգական սեռը արականի հետ փոխած տրանսսեքսուալ անհատ) կամ ԱԻՏ (արական սեռը իգականի հետ փոխած տրանսսեքսուալ անհատ):
Կարևոր է տարանջատել տրանսգենդեր և տրանսեսքսուալ անձանց տրանսվեստիտ մարդկանցից (cross dresser): Եթե տրանսգենդեր անհատի անհարմարությունը կապված է գենդերային ինքնության ու դրա արտահայտման հետ, իսկ տրանսսեքսուալ անհատի դեպքում ավելանում է նաև սեփական կենսաբանական սեռի հետ անհարմարությունը, ապա տրանսվեստիտ անհատի դեպքում խոսքը վերաբերում է միայն հագուստին կամ կերպարանքին (այս բառի հիմքը իտալերեն “vestire” (հագնվել, հագնել) բառն է): Ներկայումս տրանսվեստիտ բառն այնքան էլ կիրառելի չէ, սակայն բնութագրում է մարդկանց, ովքեր երբեմն կրում են այլ գենդերին բնորոշ հագուստ կամ կերպարանք: Այն կապ չունի սեռական կողմնորոշման և գենդերային ինքնության հետ. տրանսվետիտ անհատը կարող է լինել ինչպես նույնասեռական, այնպես էլ տարասեռական, երկսեռական կամ անսեռական, իսկ իր գենդերային ինքնությամբ` ինչպես ցիսգենդեր կին կամ ցիսգենդեր տղամարդ, այնպես էլ տրանսգենդեր կին կամ տրանսգենդեր տղամարդ: